Buongiorno,
al momento è possibile gestire la fattura con lo sconto Bonus/Ecobonus in due modi:
1) Si applica lo sconto maggiorazione sul totale documento, cliccando sulla voce sconto maggiorazione nella sezione aggiungi dati dei dati documento, ma in questo caso cambia anche il totale fattura.
2) L’importo dello sconto può essere annotato per esempio nella causale, riportando una frase del tipo : “Il corrispettivo dovuto è pari a euro 5500, per effetto dello sconto pari a euro 5500, come previsto dall’art. 121 del DL 34/2020” e successivamente modificate il netto a pagare. 
Vi inviamo la fattura es. AE.PDF che abbiamo replicato.
 
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Visualizzando la fattura:
 
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